Precalienta el horno a 390 °F.
Corta las tortillas en triángulos y acomódalas en una bandeja para hornear (de preferencia que sea una reja para que se doren de manera uniforme por ambos lados).
Hornea los triángulos de tortillas durante 8 minutos o hasta que doren. Cuando estén listos, retira del horno y reserva.
Para la salsa roja, en una olla a fuego medio alto calienta un chorro de aceite y sofríe los tomates, la cebolla, chiles guajillo, chiles de árbol y el ajo. Mezcla y cocina hasta que se suavicen. Luego vierte el agua y hierve durante 6 minutos o hasta que el agua se reduzca ala mitad.
Agrega el contenido de la olla a la licuadora y sazona con sal, licúa hasta obtener una salsa tersa. Cuela y reserva.
Para la salsa verde, en una olla a fuego medio calienta agua y cocina los tomatillos verdes, los chiles jalapeños, la cebolla y el ajo. Hierve durante 5 minutos o hasta que los tomates cambien de color.
En una licuadora agrega la mezcla de los tomates verdes junto al cilantro y la sal. Licúa hasta obtener una salsa tersa.
Coloca los totopos en un refractario y baña la mitad con la salsa verde y la otra mitad con salsa roja.
En el centro agrega el pollo desmenuzado, la crema y el queso, formando así la bandera.
Hornea hasta que el queso se gratine. Finalmente decora con cebolla, cubos de aguacate y cilantro. Sirve y disfruta.